Aby automatycznie wystawiać faktury bądź paragony ze swojego sklepu internetowego trzeba zarejestrować się w aplikacji siteor.pl. Aby zintegrować Siteor z Fakturownią należy zalogować się do swojego konta w Fakturowni, a następnie przejść do zakładki Ustawienia > Ustawienia konta. Z szarej belki po lewej stronie wybierz opcję Integracja. W sekcji Integracja z systemem Siteor zaznacz checkbox przy opcji Włącz i uzupełnił wymagane pola.  Dzięki integracji można automatycznie wystawiać faktury za zakupy dokonane w sklepie. Trzeba jednak zintegrować obie aplikacje.

Integracji dokonuje się po stronie sklepu w menu Sklep > Ustawienia sklepu , pozycja "Wystawianie faktur lub paragonów"  ( wpolu Kod autoryzacyjny API z www.fakturownia.pl trzeba podać kod ze swojego systemu fakturownia.pl ) oraz po stronie Fakturowni ( Kod pobiera z aplikacji Siteor.pl, menu: Ustawienia -> Zaawansowane ustawienia -> Kod aplikacji )

Po stronie fakturowni integracji dokonuje się w menu Ustawienia > Ustawienia konta > Integracja ( zakładka )

Po dokonaniu integracji i odpowiednim ustawieniu opcji w ustawieniach sklepu. Klient dostanie fakturę lub paragon. Można również ustawić czy faktura automatycznie się wystawi, czy dopiero po kliknięciu w danym zamówieniu w sklepie.